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士鋒生物NI-NTA蛋白提純的原理、步驟與常遇問題分析
酸)。在蛋白上樣后,帶有標(biāo)簽的蛋白特異性結(jié)合到柱子里,其他的雜蛋白流出。Ni-NTA純化介質(zhì)是Ni離子金屬螯合介質(zhì)。
蛋白過鎳柱純化的原理:Ni柱中的氯化鎳或者硫酸鎳可以與有HIs(組蛋白)標(biāo)簽的堿性蛋白蛋白結(jié)合,組蛋白標(biāo)簽一般是6個(gè)(堿性氨基酸)。在蛋白上樣后,帶有標(biāo)簽的蛋白特異性結(jié)合到柱子里,其他的雜蛋白流出。Ni柱中的氯化鎳或者硫酸鎳可以也可以與咪唑結(jié)合這時(shí)候再用咪唑洗脫,梯度洗脫,咪唑競爭性結(jié)合到硫酸鎳上,目的蛋白就被洗脫了,這時(shí)候收集浸出液,那么里面就是你要的目的蛋白,然后透析掉咪唑就行了。現(xiàn)在的柱子大多是預(yù)裝柱,也就是不用自己填柱,就是裝好鎳的傻瓜柱,也不貴,上樣,洗脫,基本兩個(gè)步驟就結(jié)束了。剩下的看你怎么處理了。
高親和Ni-NTA純化介質(zhì)(L00250)是把螯合劑(氮川三乙酸或NTA)共價(jià)偶聯(lián)到瓊脂糖介質(zhì)(4%交聯(lián))上,然后再螯合Ni2+制備而成。NTA能夠通過四個(gè)位點(diǎn)牢固的螯合Ni2+從而減少純化過程中Ni2+泄露到蛋白樣品中。Ni-NTA純化介質(zhì)可以純化任何表達(dá)系統(tǒng)(原核,酵母,昆蟲細(xì)胞和哺乳動物細(xì)胞等表達(dá)系統(tǒng))表達(dá)的天然或變性的His-標(biāo)簽蛋白。結(jié)合在介質(zhì)上的蛋白可以通過低pH緩沖液、咪唑溶液甚至溶液洗脫下來。
一、NI-NTA提純操作步驟
1. 試劑和耗材準(zhǔn)備:
Bind Buffer;Wash Buffer;Elution Buffer;柱子;填料;等。
pET.wap.ns②A1; PET21空載體; 200ml誘導(dǎo)表達(dá)菌液;
2. 步驟:
2.1 50ml滅菌離心管收集菌液,用冰冷10ml PBS清洗菌液1次,離心
2.2 重懸8ml bind buffer ,冰上超聲破碎,10s間隔,至菌液不在粘稠,分裝至EP管,
2.3 4℃ 14000r/min 20min,分離上清,沉淀用5ml Buffer A+DTT重懸
2.5混勻50%NI-NTA,吸2ml 50%NI-NTA ,上柱(做2個(gè)柱,1ml NI-NTA/柱),待*沉淀(約1h),先用10ml滅菌水洗,流速:重力作用
2.6 10ml 1*Bind Buffer 進(jìn)行平衡,流速:重力作用
2.7 將準(zhǔn)備好的樣品上樣,pET.wap.ns; PET21 only分別上柱(結(jié)合時(shí)間1h-1.5h流速控制在0.1ml/min左右, EP 管,分管收集上樣后液體)
2.8 10ml 1* Bind Buffer 洗柱子(收集洗脫液10管,流速在0.3-0.4ml/min左右)
2.9 10ml 1*Wash Buffer洗柱子(收集洗脫液10管,流速在0.3-0.4ml/min左右)
2.10 5ml 1* Elution Buffer洗柱子(收集洗脫液5管)
2.11 用15ml 0.5m NaoH清洗,時(shí)間約0.5-1h(0.5ml/min)
2.12 用20%乙醇清洗,約0.5-1h(0.5ml/min)
2.13 封好加樣口,柱子存放4℃備用
洗脫液-80保藏
試劑配方:
10×NI-NTA Bind Buffer (天然條件Binding/Lysis Buffer,100mL)
50mM NaH2PO4 7.8g NaH2PO4·2H2O(MW 156.01g/mol)
300mM NaCl 17.53g NaCl(MW58.44g/mol)
10mM imidazole 0.68g咪唑(MW68.08g/mol)
NaOH調(diào)整PH至8.0,濾膜過濾
10×NI-NTA Wash Buffer (天然條件Wash Buffer,100m L )
50mM NaH2PO4 7.8g NaH2PO4·2H2O (MW 156.01g/mol)
300mM NaCl 17.53g NaCl(MW58.44g/mol)
20mM imidazole 1.36g咪唑(MW68.08g/mol)
NaOH調(diào)整PH至8.0,濾膜過濾
10×NI-NTA Elution Buffer(天然條件Elution Buffer.,100m L)
50mM NaH2PO4 7.8g NaH2PO4·2H2O (MW 156.01g/mol)
300mM NaCl 17.53g NaCl(MW58.44g/mol)
250mM imidazole 17.0g咪唑(MW68.08g/mol)
NaOH調(diào)整PH至8.0,濾膜過濾
1X PBS (0.1M PBS, pH 7.4):
137mM NaCl(MW58.44g/mol) --------------------------------------------- 8g
2.7mMKCl(MW74.55g/mol)----------------------------------------------- 0.2g
10mMNa2HPO4 (anhydrous) (MW141.98g/mol)----------------------- 1.42 g
2mMKH2PO4 (anhydrous) (MW136.09g/mol) ------------------------- 0.27g
Distilled water ----------------------------------------------------------- 1000 ml
Mix to dissolve and adjust pH to 7.4( HCl ,調(diào)節(jié))
高壓滅菌后,Store this solution at room temperature. Dilute 1:10 with distilled water before use and adjust pH if necessary.
二、Ni-NTA 常見問題及建議
純化的組分中沒有His 標(biāo)簽的蛋白?
首先確定是蛋白沒有掛上柱還是蛋白沒有被洗脫下來。若His 標(biāo)簽蛋白沒有與柱結(jié)合:
可能原因:超聲的功率不對( 太大,蛋白炭化,太小,蛋白沒有釋放)
策略:改變超聲功率,并在超聲前加入
可能原因:樣品或者是結(jié)合緩沖液不正確:
策略:檢測pH 及樣品和結(jié)合緩沖液的組成份。確保在溶液中鰲合劑或強(qiáng)還原劑的濃度及咪唑的濃度不是太高。
可能原因:標(biāo)簽暴露不*
策略:在變性條件下( 用4-8 M 脲,或4-6 M 鹽酸胍) 進(jìn)行純化。
可能原因:His 標(biāo)簽丟失
策略1:WB 檢查His 是否表達(dá),上游構(gòu)建,改變His-tag 的位置(C- 端或 N- 端),必要時(shí)增加His 個(gè)數(shù)。
策略2:孵育的時(shí)間不夠,降低流速和增加孵育的時(shí)間。
策略3:改變螯合的金屬離子,尋找到*的結(jié)合金屬離子。
Ni2+ 通常是從宿主細(xì)胞蛋白中純化大多數(shù)6×His 標(biāo)記的重組蛋白質(zhì)的金屬離子。也是一般zui常用的離子。蛋白和金屬離子之間的結(jié)合強(qiáng)度受幾種因素影響,包括長度、位置、親和標(biāo)記在蛋白的暴露程度、所用離子的類型、以及緩沖液的pH,因此一些蛋白用其他離子可能更容易地進(jìn)行純化而不用Ni2+。
His 標(biāo)簽蛋白若沒有洗脫下來,請依次檢查:
可能原因:洗脫條件太溫和(標(biāo)記的蛋白質(zhì)仍然結(jié)合在柱上,結(jié)合力較強(qiáng))
策略:用增加咪唑的梯度洗脫或降低pH 來找出*的洗脫條件。
可能原因:降低pH 的方法洗脫的,因?yàn)槿?/span>pH 低于3.5,會導(dǎo)致鎳離子脫落
策略:改變洗脫辦法,咪唑競爭性洗脫
可能原因:蛋白已沉淀在柱上
策略:減少上樣量,或使用咪唑的線性梯度而不是分步洗脫以降低蛋白的濃度。試用去污劑或改變NaCl 的濃度,或在變性條件( 去折疊) 下洗脫( 用4-8 M 脲,或4-6 M 鹽酸胍)。
可能原因:非特異性疏水或其他相互反應(yīng)
策略:加非離子去污劑到洗脫緩沖液(如:2% Triton X-100)或增加NaCl 的濃度。
His 標(biāo)簽蛋白洗脫后雜帶較多,什么原因? 如何優(yōu)化?
高純度的蛋白是純化工作者的追求,但是由于很多天然的蛋白也會帶有HIS,所以經(jīng)常會出現(xiàn)HIS 標(biāo)簽蛋白洗脫后有一些雜帶,可能的原因和優(yōu)化的方法如下:
可能原因:蛋白酶部分降解了標(biāo)簽蛋白
策略:請?zhí)砑拥鞍酌敢种苿?/span>
可能原因:雜質(zhì)對鎳離子有更高的親和性
策略1:咪唑濃度必須優(yōu)化,以確保高純度( 宿主細(xì)胞蛋白質(zhì)的低結(jié)合) 和高產(chǎn)率( 標(biāo)記的目標(biāo)蛋白質(zhì)的強(qiáng)結(jié)合) 之間的*平衡。分步或者線性洗脫摸索出*的咪唑結(jié)合和清洗濃度;在樣品中加入與結(jié)合緩沖液同樣濃度的咪唑;咪唑的梯度不大(20 個(gè)或更多的柱床體積),可能分離出有相似結(jié)合強(qiáng)度的蛋白
策略2:篩選的緩沖液條件,NaCl 濃度,pH 的范圍都需要進(jìn)行篩選。對于單一目標(biāo)蛋白在進(jìn)行緩沖液篩選時(shí),將緩沖液、鹽、甘和還原劑設(shè)計(jì)成不同的混合配方來進(jìn)行優(yōu)化。
策略3:若以上優(yōu)化的條件都不能去除雜質(zhì)蛋白,需要考慮多步純化的思路,如利用Strep 標(biāo)簽進(jìn)行兩步純化或采用Subtractive method 進(jìn)行純化。
可能原因:雜質(zhì)和標(biāo)簽蛋白結(jié)合在一起
策略:在超聲破碎細(xì)胞之前加入去垢劑或者還原劑;增加去垢劑的濃度( 2% Triton X-100 or 2% Tween 20);或者在Wash buffer 中增加甘的濃度(50%) 減少非特異性的相互反應(yīng);考慮增加咪唑的濃度或者改變金屬離子。
可能原因:洗滌不充分
策略:增加洗滌的次數(shù),使洗滌充分。
蛋白過鎳柱純化步驟中,因?yàn)楝F(xiàn)在很多都是預(yù)裝柱,也就不用自己裝填料了,一般的蛋白純化也就只有上樣和洗脫兩個(gè)步驟了。需要注意的是純化過程中流速不應(yīng)該過快。
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